細胞介導細胞毒試驗
細胞毒是細胞介導免疫的主要效應之一，是機體的一種免疫監督機制，因此，細胞毒試驗（包括NK，ADCC，LAK，TIL，CTL等）是一項重要的免疫指標。傳統的同位素示蹤、染料排斥、熒光法等都有同位素污染、人為因素影響等缺點。FCM法綜合了上述常規法的優點，越來越引起臨床醫學家的重視。
碘化丙啶（Propidium Iodide，PI）染料排斥法 利用PI可以滲透到死細胞內使核染色的特點，用FCM分析死亡靶細胞比例。此方法還有一個51Cr釋放法不能比擬的長處，即不但可以測定單次細胞毒試驗（SCCA），也可以觀察NK細胞的再循環殺傷作用，即：效應細胞殺死一個靶細胞后，可再殺傷其他細胞的能力，稱之總細胞毒試驗（TCCA）。
FDA-FCM試驗 基本原理同PI排斥法，但它同前者相反，是以熒光染料FDA在活細胞內滯留，以計算活細胞數為基礎。FDA可以穿通活的細胞膜進入胞內，受胞內脂酶水解，產生熒光物質留于胞內；細胞受殺傷時，染料排出，以確定殺傷效應。
細胞光掃描法 通過靶細胞受效應細胞殺傷后發生形態的改變及光掃描特性變化，在排除效應細胞群體后，用特設的閾值把死活的兩群靶細胞分開，計算殺傷效應。
也有學者用雙標記細胞毒法，即用綠熒光色素標記效應細胞，用紅色熒光素標記靶細胞，在細胞裂解前，用FCM定量測定效應細胞和靶細胞的結合體形成。
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